Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprtQ99M80 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprtQ99M80 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms