Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gins4Q99LZ3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gins4Q99LZ3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms