Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sh3bp5lQ99LH9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms