Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Dnajb11Q99KV1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dnajb11Q99KV1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms