Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hps4Q99KG7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps4Q99KG7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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