Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Apobec3Q99J72 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Apobec3Q99J72 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apobec3Q99J72 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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