Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms