Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms