Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms