Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Afg3l1Q920A7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Afg3l1Q920A7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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