Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppargc1bQ8VHJ7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms