Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms