Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt79Q8VED5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms