Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q8VDP2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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