Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Slc6a20aQ8VDB9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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