Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc8Q8VD72 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc8Q8VD72 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttc8Q8VD72 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc8Q8VD72 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms