Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdc16Q8R349 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cdc16Q8R349 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cdc16Q8R349 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Cdc16Q8R349 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdc16Q8R349 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms