Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc12Q8R344 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc12Q8R344 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms