Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Casc3Q8K3W3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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