Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Otud6bQ8K2H2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms