Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Fam228aQ8CDW1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Fam228aQ8CDW1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Fam228aQ8CDW1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Fam228aQ8CDW1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Fam228aQ8CDW1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam228aQ8CDW1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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