Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrif1Q8CDD9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Lrif1Q8CDD9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrif1Q8CDD9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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