Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q8C708 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q8C708 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q8C708 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms