Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms