Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx16Q8C080 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms