Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trerf1Q8BXJ2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trerf1Q8BXJ2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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