Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ctdsp2Q8BX07 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms