Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx17Q8BVL3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms