Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl3Q8BVF2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms