Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
D130040H23RikQ8BII3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
D130040H23RikQ8BII3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms