Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Htatsf1Q8BGC0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Htatsf1Q8BGC0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms