Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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