Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ell3Q80VR2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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