Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ifna12Q80SS5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms