Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccp110Q7TSH4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccp110Q7TSH4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms