Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Dsg1bQ7TSF1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Dsg1bQ7TSF1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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