Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nek5Q7TSC3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms