Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Scn4bQ7M729 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Scn4bQ7M729 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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