Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdcl2Q78Y63 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pdcl2Q78Y63 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pdcl2Q78Y63 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdcl2Q78Y63 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms