Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx13Q6PHS6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms