Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtifQ6PEE2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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