Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ecm29Q6PDI5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ecm29Q6PDI5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ecm29Q6PDI5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ecm29Q6PDI5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ecm29Q6PDI5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ecm29Q6PDI5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms