Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mfsd13aQ6PDE8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms