Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zbtb40Q6PCS8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms