Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mtss1lQ6P9S0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mtss1lQ6P9S0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mtss1lQ6P9S0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mtss1lQ6P9S0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms