Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smchd1Q6P5D8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smchd1Q6P5D8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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