Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scaf8Q6DID3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms