Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarca2Q6DIC0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarca2Q6DIC0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms