Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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