Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Irf4Q64287 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms